GROMACS (GROningen MAchine for Chemical Simulations, дословный перевод названия — Гронингенская Машина для Химического Моделирования) - пакет молекулярной динамики для моделирования физико-химических процессов.
GROMACS - это пакет, который представляет собой набор программ, предназначенных для расчета траекторий движения отдельных частей молекулы, аппроксимированной механической системой физических материальных точек, связанных набором сил. Пакет предназначался в основном для моделирования биомолекул (белки и липиды), имеющих много связанных взаимодействий между атомами. GROMACS обеспечивает высокую скорость расчетов и для несвязанных взаимодействий.
Пакет первоначально разработан группой Германа Берендсена из департамента биофизической химии Гронингенского университета, сейчас развивается и поддерживается благодаря усилиям энтузиастов из разных стран, включая университет Уппсалы, Королевский технологический институт.
GROMACS — весьма разносторонний пакет программ для моделирования динамики крупных молекулярных систем (от тысяч до миллионов частиц). Считается, что это один из самых быстрых инструментов в своем классе.
GROMACS является программным обеспечением с открытым исходным кодом, выпущенным под лицензией GPL.
Тип приложения: другие программы для графического режима
Сайт разработчика:
Что почитать?
Разместил: