консольная программа - Infernal

Приложение предназначенное для работы с базами данных последовательностей ДНК в поиске участков, совпадающих со структурой и последовательностями РНК.

Infernal (INFERence of RNA ALignment, выравнивание последовательностей РНК) реализует частный случай (ковариантные модели) применения стохастических контекстно-свободных грамматик. Всякая ковариантная модель подобна профилю последовательности, но отличается от последнего тем, что учитывает как консенсусную последовательность, так и консенсусную вторичную структуру РНК, и, таким образом, во многих случаях является более эффективным методом определения гомологов РНК, у которых вторичная структура сохраняется в большей степени, чем первичная последовательность.

Тип приложения: консольная программа
Сайт разработчика: http://infernal.janelia.org/