Химия
MacMolPlt
Программа для отображения трехмерных молекулярных структур и мод нормальных колебаний. Допускает чтение различных файловых форматов, включая файлы ввода GAMESS (*.inp), log-файлы или IRC-файлы непосредственно для создания анимаций IRC- и DRC-типа и оптимизаций.
massXpert
massXpert - программа для имитации и анализа спектрометрических данных.
Molden
Приложение для молекулярного моделирования, визуализации молекулярных систем.
Open Babel
Open Babel - это - открытый, совместный проект, позволяющий искать, преобразовать, проанализировать, или хранить данные молекулярного моделирования, химии, биохимии, или связанных областей.
OpenThermo
OpenThermo- это пакет программ для статистической термодинамики. OpenThermo позволяет рассчитывать термодинамические функции по молекулярным данным с учетом внутренних вращений и ангармонизма колебаний.
PyMOL
3D визуализация белков, небольших молекул, молекулярных поверхностей и траекторий.
XDrawChem
XDrawChem - программа для отрисовки химических структур.